После великих географических открытий (середина XV — середина XVII вв.) в Северной Африке появились европейцы (португальцы и испанцы). Португальцы захватили Сеуту, Арсилу, Танжер. К концу XVI в. они монополизировали внешнюю торговлю Марокко, основали порты Агадир и Мазаган, ставшие главными португальскими торговыми пунктами на атлантическом побережье.
С XVI века в Марокко правила династия шерифов (шорфа) из рода Са’дидов (1510 — 1659). Са’дидам удалось остановить португальскую экспансию в Марокко и Мавританию. К концу XVI в. португальцев стали вытеснять испанцы.
В XVII в. возобновилось пиратство, вызванное массовым изгнанием мусульман из Кастилии, аль-Андалуса и Каталонии. В основном корсары, добравшиеся в 1622 г. вместе с алжирскими разбойниками до Ла-Манша, находились в Сале. С 1627 по 1641 г. Корсарская республика в Сале не зависела от центральной власти.
Во второй половине XVII в. активность пиратов затихает и они практически исчезают с подъемом династии Алауитов (шерифы из рода Филали). В середине XVIII в. алауитское государство вступило в полосу затяжного кризиса, вызванного восстанием войск, сопротивлением городов и берберскими выступлениями.
В Тунисе сформировалось независимое от Османской империи государство во главе с Хусайнидами (1705 — 1957). В Ливии утвердилась местная династия Караманлы (1711 — 1835), номинально сохранявшая верность султану. В 1835 г. страна перешла под прямое управление Османской империи.